清凉寺始建于南朝，是中国佛教禅宗五家之一——法眼宗的发源地。法眼宗为南唐高僧文益禅师所创，其禅学思想在中国佛教史上具有崇高的地位和价值，影响远及日本、韩国及东南亚，历史意义十分深远。为此，南京市宗教局、南京市佛教协会与南京市园林局、清凉山公园管理处经过协商，本着循序渐进的原则，于2009年1月将清凉寺原有的一座殿堂及五间瓦房交给佛教界，同年6月20日，举行佛像开光，作为宗教活动场所正式对外开放。2024年11月，清凉寺举行法眼祖庭南京清凉寺遗址保护暨展示工程落成仪式，举办了2024法眼宗与佛教中国化学术研讨会，寺院各项建设取得了长足进步。

清凉寺地址：鼓楼区清凉山83号。